俗的说，去离子水和蒸馏水是两类水，而不是两种水。普遍来说蒸馏水的离子比去离子水高，去离子去过不经过紫外消毒或者滤膜的话，可能会带点微生物，看具体工艺。这两种针对的要求不同可以改，看你具体要求了。
一般分析的时候使用蒸馏水，而工厂生产是使用去离子水。这两种水的其他不同都是由制备方法不同所导致所以归根结底就是制备方法不同。各方法做出来的水的纯度都会随着重复次数的增加而提高。纯化任务要考虑的是原混合物的具体情况，选择有针对性的纯化方法。
工业去离子水设备工艺大致可分为以下三种：
种：采用阳阴离子交换树脂取得的去离子水，一般通过之后，出水电导率可降到10us/cm以下，再经过混床就可以达到1us/cm以下了。但是这种方法做出来的水成本极高，而且颗粒杂质太多，纯水设备厂家，达不到理想的要求。目前已较少采用了。
***种：预处理(即砂碳过滤器+精密过滤器)+反渗透+混床工艺，这种方法是目前采用的，饮用纯水设备，因为反渗透投资成本也不算高，可以去除90%已上的水中离子，剩下的离子再通过混床交换除去，这样可使出水电导率：0.06左右。这样是目前的方法。
